По указу Петра Великого
11 (22) февраля 1713 года указом Петра I на одном из островов в дельте Невы, получившего с тех пор наименование "Аптекарский", был основан огород для разведения в нём лекарственных растений. Разбивали его под руководством президента Аптекарского приказа лейб-медика (личного врача) Петра Роберта Карловича Арескина (Эрскина, 1677 - 1718), шотландца по происхождению.
Через сто лет Аптекарский огород состоял уже не только из ботанического, но и научно- и учебно - медицинского отделений. В 1823 году по инициативе управляющего Министерством внутренних дел Виктора Павловича Кочубея он был переименован в Императорский ботанический сад. До 1850 года его директором был крупный европейский ботаник Фридрих Эрнст (Фёдор Богданович) Фишер (1782 - 1854), составивший Каталог семян ботанического сада; позднее должность Главного ботаника и, с 1875 года, директора занимал Эдуард Людвигович Регель (1815 - 1892). В Ботаническом саду были организованы музей и лаборатории; по проекту Иеронима Севастьяновича Китнера и графа Николая Ивановича де Рошфора была отстроена Большая пальмовая оранжерея. На российских и международных выставках экспозиции Ботанического сада неизменно удостаивались медалей. Экспедиции, устраиваемые служившими в нём учёными, охватили весь земной шар.
В 1913 году в связи с 200-летием Ботанического сада ему было присвоено имя Петра Великого. Ещё через 100 лет, в 2014 году, на его территории был установлен бронзовый бюст царя-основателя (скульптор Олег Сатин).
После революции
В 1925 году массив получил статус Главного ботанического сада СССР. Пятью годами позже он был передан Академии наук, а ещё через год был слит с Ботаническим музеем. В 1940 году ему было присвоено имя знаменитого учёного-ботаника, президента Академии наук с 1936 года Владимира Леонтьевича Комарова (1869 -1945), работавшего в Ботаническом саду с 1898 года и проживавшего в 1899 - 1934 годах в доме № 2 по Песочной (с 1940 года - Профессора Попова) улице, на фасаде которого установлена мемориальная доска.
В годы блокады здания оранжерей и коллекции Ботанического сада серьёзно пострадали от бомбардировок и морозов. Умирая от голода, его сотрудники из последних сил старались поддерживать в оранжереях необходимую температуру воздуха, унося наиболее редкие экземпляры даже к себе на квартиры. На территории сада были установлены зенитные орудия.
В наши дни
Сегодняшние коллекции Ботанического сада насчитывают 80 тысяч образцов редчайших растений. Протяжённость оранжерей общей площадью 1 га - 1 км. В тропических, субтропических, папоротниковых оранжереях проводятся лекции и экскурсии, в том числе - для школьников и дошкольников. Особенно красивы оранжереи в марте-апреле, когда в них цветут азалии и рододендроны...
